香港能夠成為台灣第2大出口市場，一個重要原因是，在兩岸尚未開放“三通”直航前，香港多年來一直是兩岸貿易最重要中轉橋樑。到了2008年，兩岸逐步全面開放直航大“三通”後，外界一度憂慮香港中轉地位下降，但是由於香港有其獨特優勢，海空運輸發達，而且完全免關稅，不少台灣商品、特別是在大陸投資的台商工廠，大量原物料仍透過貨櫃船先運往香港，再分拆小船、通過河運轉往珠三角一帶的台商工廠或外資工廠，同時也有部分轉口輸往東南亞等地。巫英臣指出，現時輸往香港的台灣貨品，7至8成是轉口貨運，香港仍是兩岸經貿的一個重要轉口基地。