黄岩岛国家级自然保护区实行严格保护。未经批准，禁止从事捕捞、采矿和采挖珊瑚、珊瑚礁、砗磲等破坏海洋珍稀物种和自然生态系统的活动。除法律法规规定的情形以及因保护管理需要组织开展的活动外，任何单位和个人不得进入保护区。对违反保护区保护和管理规定的行为，任何单位和个人有权举报，管理机构和有关部门接到举报后，应当依法及时处理。