科大医院也坐落于澳门科技大学校园内，是全澳门唯一一所具备临床、教学，及科研支持的医疗体系。科大医院前身是以中医为主的澳门科技大学中医诊疗中心，2006年正式发展为一所设备完善、结合中西医疗服务的地标性综合医院。此外，澳门科技大学中药质量研究国家重点实验室由国家科技部批准，于2011年1月25日正式挂牌成立，是中国中医药领域成立的首个国家重点实验室。