水下考古工作是我国文物工作中国家支持的重点项目。二十年来，根据国家文物局的工作安排，既开展了沿海水下文物调查等基础性工作，又在祖国的四大海域—渤海、黄海、东海、南海及长江流域先后进行了一系列具有抢救保护性质的水下沉船遗址及其他水下文物遗迹的调查、发掘工作。具代表性的调查与发掘有：辽宁绥中三道岗元代沉船、山东胶南鸭岛明代沉船、浙江渔山小白礁青岛沉船、福建连江定海白礁一号沉船、平潭碗礁一号清代沉船、大练岛一号元代沉船、东山冬古湾明末战船、广东台山南海一号沉船、海南文昌宝陵港清初沉船、西沙群岛华光礁一号南宋沉船等遗址，以及四川涪陵白鹤梁水下题刻调查、广东新会银洲湖海战遗迹调查、香港竹篙湾水下文物调查、西沙群岛水下考古调查、全国水下文物普查，并承担了为期三年的中肯合作拉姆群岛海域水下考古调查项目。