目前中国高校的思想政治工作也面临著一些挑战。例如,一段时期以来,一些西方反动势力加大对中国高校的思想渗透,“西化”“分化”的思潮有所抬头。这些势力以时代思想应该多元化为藉口,鼓噪高校教育的指导思想不能只有一家,应该进行多家竞爭。
有人认为马克思主义是19世纪工业革命的產物,早已过时;有人认为马克思主义是革命学说、批判理论,搞社会主义建设用不上。在一些高校,比较单一强调自然科学和社会科学的培养,相对忽视对马克思主义信仰、中国特色社会主义共同理想的教育。