两岸经贸往来可能随着两岸政治关系恶化受到严重影响，台湾“反渗透法”的实施、ECFA到期后是否延续、两岸航班减少等等非经济因素造成的影响都非常巨大。同时，台湾持续深化的“反中亲美”路线和台美关系升级，也会使本已紧张的两岸关系进一步恶化，两岸经贸关系受到严峻挑战。