香港口岸区及內地口岸区的出入境部门及执法部门早前已加强培训，为高铁通车投入服务。其中內地口岸区的边检部门早前进行极端压力测试，应付一旦出现人流超过预期的情况。派驻西九龙站派出所的內地民警亦完成培训，內容包括以英语执法作出拘捕行动，认识香港法律知识、一地两检执勤程序，甚至面对广大民眾及香港传媒“监督”的应对等。