福建自由贸易试验在实施过程中仍存难题待解。多位专家受访时均指出，政治因素制约明显，台湾方面对自由贸易试验区相关政策知晓率不高，监督合作机制有待完善，產业对接能力较弱，专业人才短缺，相关配套设施建设仍需加强等。