粤港澳大湾区并不是在同一个政治经济体制下运行的，因此形成了一定的局限。但大湾区内若要实现有效“融合”，必须要克服这些相应的难点和痛点。例如，大湾区内要素流动怎样才能更顺畅？如何使港澳同胞在大湾区内生活更便捷？与民生相关的政策可否能取得实际性突破？等等。诸多问题亟待解决。