全程马拉松的路线遍及九龙、新界及香港岛，选手先经西九龙公路、昂船洲大桥，跑至新界的汀九桥折返，再经长青隧道、青葵公路，穿过西区海底隧道(西隧)跑到香港岛，最后在铜锣湾维多利亚公园冲线。

　　多年来，西隧一直被选手视为“魔鬼路段”，它既有斜坡路段，亦有急弯。当天，有全程马拉松男选手在隧道內尝试突围，但在跑离隧道的上斜坡路段已后劲不继，被其他选手赶过。